جلسه ٢ بخش نظری - آزمون‌فرض آماری، Student t-test، معنی p-value

ورکشاپ R

جلسه ١ بخش نظری - مقدمات آمار، میانگین، واریانس، انحراف معیار، میانه، چارک‌ها

جلسه ١ بخش عملی - مشاهده ژنوم در UCSC Genome Browser، نصب R و RStudio، مقدمات R

جلسه ٢ بخش نظری - آزمون‌فرض آماری، Student t-test، معنی p-value

جلسه ٢ بخش عملی - داده‌پایگاه برهم‌کنش ژنی و پروتئینی String-db، تحلیل اولیه‌ی داده‌های بیان ژن، رسم Heatmap

جلسه ٣ بخش نظری - مقیاس Log2 برای تحلیل بیان ژن‌ها، Log-fold change، تحلیل تفاوت بیان ژن‌ها

جلسه ٣ بخش عملی - داده‌‌پایگاه Coremine: ارتباط عناصر زیستی طبق مقالات، آزمون t روی داده‌های بیان ژن

جلسه ٤ بخش نظری - خوشه‌بندی سلسله‌مراتبی (Hierarchical Clustering)، فاصله‌ی اقلیدسی محورها

جلسه ٤ بخش عملی - کتابخانه‌ی ggplot2 برای ساخت نمودارهای بیوانفورماتیک، رسم نمودار میله‌ای بیان ژن

جلسه ٥ بخش نظری - ضریب همبستگی Pearson

جلسه ٥ بخش عملی - محاسبه‌ی ضریب همبستگی Pearson، رسم trendline

جلسه ٦ بخش نظری - تطابق رشته‌های DNA یا پروتئین، الگوریتم‌های برنامه‌سازی پویا (Dynamic Programming)

جلسه ٦ بخش عملی - کتابخانه‌ Reshape2، نمودار جعبه‌ای (Box-plot)، نمودار ویولن (Violin-plot)

جلسه ٧ بخش نظری - ضریب همبستگی ناپارامتری Spearman Correlation Coefficient

جلسه ٧ بخش عملی - تحلیل هم‌زمان چند ژن با استفاده از apply، sapply و محاسبه ضریب Spearman

جلسه ٨ بخش نظری - خطای استاندارد (Standard Error)

جلسه ٨ بخش عملی - نوشتن تابع در R

جلسه ٩ بخش نظری - (Principal Components Analysis (PCA

جلسه ٩ بخش عملی - رسم نمودار PCA روی داده‌های بیان ژن

جلسه ١٠ بخش نظری - آزمون‌ آماری ANOVA

جلسه ١٠ بخش عملی - محاسبه‌‌ی ANOVA

جلسه ١١ بخش نظری - آزمون فیشر Fisher-test

جلسه ١١ بخش عملی - نمودار همبستگی بیان، تحلیل کیفیت آزمایش بر اساس فاصله‌ی بین تکرارها

جلسه ١٢ بخش نظری - آزمون‌های ناپارامتری نظیر Wilcoxon

جلسه ١٢ بخش عملی - پروژه Fantom، آزمون نرمال‌بودن داده‌هاَ، انجام آزمون‌های ناپارامتری