آموزش طراحی محاسباتی دارو

poster
پیش‌نمایش دوره

امروزه طراحی دارو برای بیماری‌های جدید با روش‌های محاسباتی در دنیا بسیار فراگیر شده است، این روش‌ها مدت زمان، هزینه و ریسک طراحی دارو برای بیماری‌های مختلف به شدت پایین آورده. کاربرد روش‌های محاسباتی در ... ادامه

برگزارکننده:  مکتب‌خونه  مکتب‌خونه
مدرس دوره:
3.5 (2 رای)
سطح: مقدماتی
 پلاس
  
زمان مورد نیاز برای گذراندن دوره:  8 ساعت
مجموع محتوای آموزشی:  8 ساعت ویدئو
 (قابل دانلود می‌باشد)

آنچه در این دوره می‌آموزیم:

 آشنایی با روش‌های محاسباتی طراحی دارو

 آشنایی با پایگاه داده‌‌های مهم بیوانفورماتیک و طراحی دارو

 تفاوت روش‌های محاساباتی و آزمایشگاهی برای طراحی یک دارو

 نرم‌افزارهای مهم و کاربردی در طراحی دارو

پیش‌نیاز‌ها

آشنایی با زبان برنامه‌نویسی R، کار شما را برای فهم پیاده‌سازی‌ها راحت‌تر خواهد کرد، اگرچه ما سعی می‌کنیم پیاده‌سازی‌ها را به نحوی انجام دهیم که به صورت کامل برای همه قابل درک باشد. بقیه بخش‌ها به جز قسمت‌های برنامه‌نویسی نیاز به پیش نیاز خاصی ندارد. 

سرفصل‌های دوره آموزش طراحی محاسباتی دارو

مقدمه‌ای بر طراحی محاسباتی دارو و بیان تعاریف و پیش‌نیازهای اولیه

دراین فصل به بیان مقدمه‌ای در مورد طراحی محاسباتی دارو خواهیم پرداخت، یک دید کلی در مور روش‌های طراحی محاسباتی به دست می‌آوریم. سپس تمام مفاهیم اولیه‌ای که در طول دوره به آن نیاز داریم را در این فصل خواهیم گفت. تمام روش‌های نمایش مولکول‌ها در این فصل بیان خواهد شد.

  مقدمه‌ای بر زیست‌شناسی سلولی مولکولی - بخش اول
مشاهده
"16:44  
  مقدمه‌ای بر زیست شناسی سلولی مولکولی - بخش دوم
مشاهده
"18:18  
  کشف دارو و ویژگی‌های مولکول‌های دارویی
"19:14  
  معیارهای شباهت مولکول‌های دارویی با یکدیگر
"25:55  
  مقدمه‌ای بر زبان برنامه‌نویسی r و پیاده‌سازی معیارهای شباهت مولکولی
"19:42  
آشنایی با پایگاه‌ها داده‌های مهم بیوانفورماتیک و طراحی دارو
  آشنایی با پایگاه داده‌ی pdb
مشاهده
"30:23  
  آشنایی با پایگاه داده bindingdd
"23:22  
  آشنایی با پایگاه داده‌ی zinc
"21:15  
  آشنایی با پایگاه داده pubchem
"22:03  
داکینگ مولکولی و طراحی دارو برای یک هدف معین
  داکینگ مولکولی چیست؟
مشاهده
"08:56  
  داکینگ، روش‌ها و برنامه‌ها
"14:43  
  آشنایی با فرمت‌های نمایش مولکولی و نصب نرم‌افزارهای داکینگ
"17:01  
  داکینگ با autodockvina
"22:33  
  تفسیر نتایج داکینگ و مشاهده‌ی نتایج با autodocktools
"18:05  
  داکینگ با نرم‌افزار - داکینگ تحلیل نتایج chemira
"25:08  
روش‌های بیوانفورماتیکی در طراحی دارو
  همترازی دو توالی
"18:34  
  همترازی چندگانه و هم ترازی محلی
"19:41  
  BLAST و ابزار آن
"16:50  
  structer alignment (همترازی ساختار دو پروتئین)
"11:39  
روش‌‍‌های فارماکوفور و Qsar در طراحی محاسباتی دارو
  روش‌های فارماکوفور - بخش اول
"13:45  
  روش‌های فارماکوفور - بخش دوم
"06:54  
  آشنایی با qsar و نرم‌افزار padel
"16:55  
  رگرسیون و استخراج ویژگی
"26:34  
  clustering - classification
"15:49  
  بهینه‌سازی ساختار با heprchem و پیاده‌سازی qsar
"22:27  

درباره دوره

امروزه طراحی دارو برای بیماری‌های جدید با روش‌های محاسباتی در دنیا بسیار فراگیر شده است، این روش‌ها مدت زمان، هزینه و ریسک طراحی دارو برای بیماری‌های مختلف به شدت پایین آورده. کاربرد روش‌های محاسباتی در طراحی دارو و واکسن در دوران شیوع بیماری کرونا به وضوح مشخص بود. 

در برخی از کشورهای پیشرفته طراحی دارو به عنوان یک رشته‌ی دانشگاهی ارائه می‌شود و بازار کار این رشته به شدت بازار کار خوبی است. علاوه بر این کسانی که قصد ادامه‌ی تحصیل در این رشته و یا رشته‌های مرتبط را دارند، نیاز است که به صورت تخصصی با طراحی دارو آشنایی داشته باشند.

ما در این دوره تمام روش‌های محاسباتی که در طراحی دارو کاربرد دارد را بررسی و نرم‌افزارهای کاربردی در این دوره را آموزش خواهیم داد. بعد از پایان این دوره شما با همه‌ی روش‌های طراحی محاسباتی دارو آشنایی پیدا خواهید کرد.

درباره استاد

maktabkhooneh-teacher احمدرضا رسولی

احمدرضا رسولی، دانشجوی دکترای بیوانفورماتیک دانشگاه تهران و دانش آموخته‌ کارشناسی ارشد بیوانفورماتیک از دانشگاه تربیت مدرس است. ایشان اولین فردی هستند که با داشتن مدرک کارشناسی ارشد بیوانفورماتیک وارد دکترای این رشته شدند. طراحی محاسباتی دارو، روش‌های هوش مصنوعی در طراحی دارو و روش‌های یادگیری ماشین در بیوانفورماتیک از علاقه‌های ایشان است. از جمله سوابق آموزشی ایشان می‌توان به تدریس بیوانفورماتیک و طراحی دارو در موسسات مختلف و هم چنین تدریس ریاضیات برای دانش آموزان کنکوری و دانشگاهی نام برد.

مشاهده پروفایل و دوره‌‌های استاد

نظرات کاربران

تا کنون نظری برای این دوره ثبت نشده است. برای ثبت نظر باید ابتدا در دوره ثبت نام کرده و دانشجوی دوره باشید.

دوره‌های پیشنهادی

سوالات پرتکرار

پس از سپری شدن زمان دوره، به محتوای دوره دسترسی خواهم داشت؟
بله؛ پس از سپری شدن مدت زمان دوره شما به محتوای دوره دسترسی خواهید داشت و می توانید از ویدئوها، تمارین، پروژه و دیگر محتوای دوره در صورت وجود استفاده کنید ولی امکان تصحیح تمارین توسط پشتیبان و دریافت گواهی نامه برای شما وجود نخواهد داشت.

محاسبات دارو چیست؟

محاسبات دارویی به فرآیند دقیق تعیین دوزهای مناسب دارو برای بیماران اشاره دارد. این محاسبات شامل تبدیل واحدها، محاسبه حجم و غلظت داروها و تعیین سرعت انفوزیون است. در عمل، پرستاران و داروسازان با استفاده از دانش داروشناسی و فرمول‌های ریاضی، مقدار دقیق داروی مورد نیاز بیمار را محاسبه می‌کنند تا از اثربخشی درمانی و کاهش عوارض جانبی اطمینان حاصل شود. آموزش طراحی محاسباتی دارو، به فراگیری مهارت‌های لازم برای انجام این محاسبات اشاره دارد.

این آموزش شامل یادگیری فرمول‌های مورد نیاز، تکنیک‌های تبدیل واحد و استفاده از ابزارهای محاسباتی پیشرفته است. با پیشرفت تکنولوژی، روش‌های محاسباتی جدیدی نیز در طراحی دارو مورد استفاده قرار می‌گیرند که می‌توانند به کاهش زمان و هزینه‌های توسعه دارو کمک کنند. این روش‌ها شامل مدل‌سازی مولکولی، داکینگ دارویی و تحلیل‌های بیوانفورماتیکی هستند که به دانشمندان امکان می‌دهند با دقت بیشتری داروهای جدید را طراحی کنند.

مقدمه‌ای بر شیمی محاسباتی و کاربردهای آن در طراحی دارو

شیمی محاسباتی، ابزاری قدرتمند در کشف دارو است که با مدل‌سازی مولکولی، فرآیندهای شیمیایی را بدون آزمایشگاه شبیه‌سازی می‌کند. این رویکرد، زمان و هزینه‌های توسعه دارو را کاهش داده و احتمال موفقیت در مراحل بالینی را افزایش می‌دهد. آموزش طراحی محاسباتی دارو به دانش‌پژوهان کمک می‌کند تا با اصول رشته طراحی دارو آشنا شده و در پروژه‌های دارویی مشارکت کنند. با پیشرفت‌های اخیر در هوش مصنوعی، شیمی محاسباتی به کشف داروهی جدید و مؤثرتر کمک می‌کند.

انواع روش های محاسباتی دارو

در حوزه آموزش طراحی محاسباتی دارو، روش‌های متعددی وجود دارد که هرکدام کاربردهای خاص خود را دارند؛ از جمله:

1.     داکینگ مولکولی: این روش به ما اجازه می‌دهد تا برهم‌کنش‌های بین مولکول‌های کوچک و پروتئین‌های هدف را شبیه‌سازی کنیم که برای پیش‌بینی موقعیت‌های اتصال داروها ضروری است.

2.     فارماکوفور مدلینگ: با تعریف ویژگی‌های کلیدی مولکول‌های دارویی که برای فعالیت بیولوژیکی ضروری هستند، این روش به ما کمک می‌کند تا داروهای جدید با خواص مشابه را طراحی کنیم.

3.     QSAR (ارتباط کمی ساختار-فعالیت): این روش از روابط ریاضی برای پیش‌بینی فعالیت بیولوژیکی مولکول‌ها بر اساس ساختار شیمیایی آن‌ها استفاده می‌کند.

4.     طراحی دارو بیوانفورماتیک: این روش از داده‌های بیوانفورماتیکی و تکنیک‌های محاسباتی برای شناسایی و بهینه‌سازی مولکول‌های دارویی استفاده می‌کند. با استفاده از پایگاه‌های داده‌های بزرگ و الگوریتم‌های پیچیده، محققان می‌توانند سریع‌تر و دقیق‌تر به داروهای جدید دست یابند. این روش‌ها شامل مدل‌سازی مولکولی، غربالگری مجازی و شبیه‌سازی دینامیک مولکولی هستند که هرکدام به نوبه خود در فرآیند کشف دارو نقش مهمی ایفا می‌کنند. 

البته این روش‌ها، با پیشرفت‌های اخیر در هوش مصنوعی، به ابزارهای قدرتمندی برای کشف و طراحی داروهای جدید تبدیل شده‌اند.

کارگاه‌های آموزش طراحی محاسباتی دارو

شرکت در کارگاه طراحی دارو و دوره‌های آنلاین، فرصتی استثنایی برای دانشجویان است تا دانش عملی خود را فراتر از محدوده‌های نظری کلاس‌های دانشگاهی گسترش دهند. آموزش طراحی محاسباتی دارو از طریق این کارگاه‌ها، مهارت‌های تخصصی را در محیطی کاربردی ارائه می‌دهد و به دانشجویان امکان می‌دهد تا با ابزارهای پیشرفته و روش‌های نوین آشنا شوند. این تجربه‌ها، آمادگی برای ورود به بازار کار را افزایش داده و به دانشجویان کمک می‌کند تا با اعتماد به نفس بیشتری در مسیر حرفه‌ای خود قدم بردارند.

اهمیت آموزش بیوپایتون در آموزش طراحی دارو

آموزش بیوپایتون، از مقدماتی تا پیشرفته، برای کسانی که در حوزه آموزش طراحی محاسباتی دارو فعالیت می‌کنند، اهمیت بسزایی دارد. بیوپایتون به‌عنوان یک ابزار قدرتمند، امکان پردازش داده‌های بیولوژیکی و شیمیایی را فراهم می‌کند و در نتیجه، به تسریع فرآیند کشف و طراحی داروهای جدید کمک شایانی می‌کند. دانش پایه و تخصصی در بیوپایتون، محققان را قادر می‌سازد تا با دقت و سرعت بیشتری، تحلیل‌های مولکولی انجام دهند و به نتایج قابل اعتمادی دست یابند. این دانش، پلی است بین داده‌های علمی و تصمیم‌گیری‌های کلیدی در طراحی دارو، که می‌تواند مسیر پیشرفت علمی را هموار سازد.

بازار کار طراحی دارو

بازار کار طراحی دارو، با توجه به پیشرفت‌های مداوم در علم و فناوری، رو‌به‌رشد است. افرادی که در زمینه آموزش طراحی محاسباتی دارو مهارت‌های خود را توسعه داده‌اند، می‌توانند از فرصت‌های شغلی متنوعی بهره‌مند شوند. توانایی در مذاکره و ارتباطات قوی نیز می‌تواند به افزایش فرصت‌های شغلی و پیشرفت حرفه‌ای کمک کند. علاوه‌بر این، داشتن تخصص در طراحی دارو می‌تواند درهای مهاجرت به کشورهایی با بازار کار پویاتر را برای افراد باز کند، که این امر می‌تواند به افزایش چشم‌انداز شغلی و بهبود کیفیت زندگی منجر شود.

معرفی دوره آموزش طراحی محاسباتی دارو

این یک دوره مقدماتی است که توسط احمدرضا رسولی، دانشجوی دکترای بیوانفورماتیک دانشگاه تهران تهیه شده است. زمانِ لازم برای گذراندنِ دوره‌ی پیشِ رو 8 ساعت است. استاد رسولی این دوره را با زبان روان و ساده به شرکت‌کنندگان تدریس خواهد کرد. شما می‌توانید 2 جلسه از تدریس ایشان را به صورت رایگان تماشا کنید و با سبک تدریس‌ و بیان‌شان آشنا شوید.

سرفصل‌های دوره به صورت زیر است:

1.     مقدمه‌ای بر طراحی محاسباتی دارو و بیان تعاریف و پیش‌نیازهای اولیه

2.     آشنایی با پایگاه‌ها داده‌های مهم بیوانفورماتیک و طراحی دارو

3.     داکینگ مولکولی و طراحی دارو برای یک هدف معین

4.     روش‌های بیوانفورماتیکی در طراحی دارو

5.     روش‌‍‌های فارماکوفور و Qsar در طراحی محاسباتی دارو

پیش‌نیازهای لازم برای دوره طراحی محاسباتی دارو

درک و مهارت در زبان برنامه‌نویسی R می‌تواند به شما کمک کند تا با سهولت بیشتری مفاهیم پیاده‌سازی‌های ما را درک کنید. با‌این‌حال، ما تلاش می‌کنیم که پیاده‌سازی‌ها را به شیوه‌ای ارائه دهیم که برای تمامی شرکت‌کنندگان، حتی بدون دانش قبلی R، قابل فهم باشد. لازم به ذکر است که سایر بخش‌های دوره به جز برنامه‌نویسی، نیازمند دانش پیشین خاصی نیستند.

این دوره برای چه کسانی مفید خواهد بود؟

این دوره مخصوصِ: فارغ‌التحصیلان و دانشجویان کارشناسی، کارشناسی ارشد و دکترای انواع گرایش‌های زیست‌شناسی، شیمی، داروسازی، پزشکی، بیوتکنولوژی پزشکی و دارویی، میکروبیولوژی، کشاورزی، ژنتیک، باکتری‌شناسی، ویروس‌شناسی، ایمونولوژی، قارچ‌شناسی، انگل‌شناسی، بیوشیمی، پزشکی مولکولی، فرآورده‌های بیولوژیک و محققین مشغول در تحقیقات دارویی، پزشکی و کشاورزی است.

آموزش طراحی محاسباتی دارو در مکتب خونه

یادگیری طراحی محاسباتی دارو، کلید ورود به عرصه‌ای نوین و پرچالش در حوزه آموزش داروسازی است. این دانش، با تلفیقی از شیمی، بیولوژی و فناوری اطلاعات، به شما امکان می‌دهد تا در درک و طراحی داروهای جدید پیشگام باشید. مکتب خونه، با بهره‌گیری از دانش و تجربه اساتید مجرب، محیطی ایده‌آل برای فراگیری این مهارت‌های تخصصی فراهم کرده است.

دوره‌های آموزش طراحی محاسباتی دارو در مکتب خونه، با تأکید بر کاربردی بودن و به‌روزرسانیِ مستمر محتوا، شما را برای موفقیت در این حوزه آماده می‌کند. همین حالا ثبت‌نام کنید و در مسیر تبدیل شدن به یک متخصص برجسته قدم بردارید. همچنین در مکتب خونه انواع دوره آموزش برنامه نویسی پایتون، آموزش برنامه نویسی R و همچنین آموزش پزشكی و داروسازی به عنوان و پیش نیاز این دوره موجود است.

poster
پیش‌نمایش دوره
  
برگزار کننده:  مکتب‌خونه
  
زمان مورد نیاز برای گذراندن دوره:  8 ساعت
مجموع محتوای آموزشی:  8 ساعت ویدئو
 (قابل دانلود می‌باشد)