آموزش جامع بیوانفورماتیک سیستمها: تحلیل شبکههای پروتئینی (PPI) و میکروآرنا (miRNA) با Cytoscape
در عصر دادههای عظیم زیستی، ترسیم یک شبکه ساده کافی نیست؛ هنر واقعی در تفسیر و استخراج معنا از دل این پیچیدگیهاست. دوره “تحلیل شبکههای پروتئین-پروتئین و میکروآرنا” دقیقاً همان حلقهی مفقودهای است که پژوهشگران ... بیشتر
حسین نوراللهی
بهروزرسانی: ۱۴۰۴/۱۰/۲۸
آنچه در این دوره میآموزید
تسلط بر Cytoscape | نصب، محیط کاربری و مدیریت حرفهای پلاگینها
منابع دادهای | استخراج شبکه از دیتابیسهای معتبر STRING و STITCH
خوشهبندی و ماژولیابی | شناسایی کلاسترها و کمپلکسهای پروتئینی با الگوریتم MCODE
شکار ژنهای کلیدی | شناسایی Hub Geneها و باتلنکهای شبکه با افزونه CytoHubba
دنیای میکرو RNA | مروری بر بیوژنز و مکانیسم اثر miRNAها
دنیای میکرو RNA | پیشبینی miRNAها و تارگتهای miRNA با miRWalk
محتوای دوره
پیشنیازها
با فراگیری دوره دراگ ریپورپوزینگ بالینی و دوره پیش رو، قادر خواهید بود شبکه های تعاملی دارو-پروتئین پیشرفته با هدف انتشار مقالات High Impact ترسیم کنید.
درباره دوره
در عصر دادههای عظیم زیستی، ترسیم یک شبکه ساده کافی نیست؛ هنر واقعی در تفسیر و استخراج معنا از دل این پیچیدگیهاست. دوره “تحلیل شبکههای پروتئین-پروتئین و میکروآرنا” دقیقاً همان حلقهی مفقودهای است که پژوهشگران علوم زیستی برای ارتقای سطح مقالات و پایاننامههای خود به آن نیاز دارند.
شبکههای پروتئینی (PPI) و برهمکنشهای miRNA-mRNA کلید درک مکانیسمهای مولکولی بیماریها، بهویژه سرطان هستند. در این دوره فشرده و کاملاً کاربردی، شما یاد میگیرید چگونه با استفاده از استانداردترین ابزارهای جهانی (مانند Cytoscape، STRING و miRWalk)، از لیستهای طولانی ژنها به ماژولهای عملکردی، ژنهای هاب (Hub Genes) و مسیرهای سیگنالینگ حیاتی برسید.
ما در این دوره از کلیگویی پرهیز کردهایم. هدف این است که شما پس از پایان دوره بتوانید دادههای خام خود را به تصاویر و نمودارهای استاندارد برای چاپ در ژورنالهای معتبر (Publication-Quality) تبدیل کنید.
در این دوره تخصصی، ما از مقدمات عبور کرده و مستقیماً به سراغ مهارتهایی میرویم که برای تعریف پایاننامه و نگارش مقالات ISI به آنها نیاز دارید. آنالیز شبکههای پروتئین-پروتئین (PPI) به شما امکان میدهد تا نقشههای پیچیده سلولی را رمزگشایی کنید، مسیرهای سیگنالی بیماریزا را بشناسید و کاندیداهای دارویی جدید را کشف کنید.
اما این همه ماجرا نیست! در بخش دوم این دوره، ما لایه جدیدی از پیچیدگی و جذابیت را به تحلیلهای شما اضافه میکنیم: میکروآرناها (miRNAs). شما یاد میگیرید چگونه برهمکنشهای تنظیمی بین miRNA و ژنهای هدف را مدلسازی کنید؛ مهارتی که میتواند سطح علمی مقالات شما را به شدت ارتقا دهد.
چرا این دوره منحصر به فرد است؟ این آموزش “تئوری محض” نیست. ما با رویکردی کاملاً عملی (Hands-on)، ابزارهای قدرتمندی همچون Cytoscape (نرمافزار استاندارد جهانی)، دیتابیس STRING، و پلاگینهای حیاتی مثل MCODE و CytoHubba را بررسی میکنیم. در پایان این دوره، شما قادر خواهید بود یک پروژه بیوانفورماتیک کامل را از استخراج داده تا مصورسازی حرفهای شبکه انجام دهید.
اطلاعات بیشتر
گواهینامه
پس از گذراندن محتوای دوره به صورت آنلاین (بدون دانلود) در سایت مکتبخونه، در صورتی که حد نصاب قبولی در دوره را کسب و تمرین ها و پروژه های الزامی را ارسال کنید، گواهینامه رسمی پایان دوره توسط مکتبخونه به اسم شما صادر شده و در اختیار شما قرار میگیرد.
قابل اشتراکگذاری در
درباره استاد
دکتر حسین نوراللهی، چهرهای برجسته و چندوجهی در جامعه علمی ایران، بهعنوان مدرس دانشگاه، پژوهشگر پیشرو و کارآفرین آموزشی شناخته میشود. ایشان با تلفیق دانش عمیق آکادمیک و مهارتهای فنی پیشرفته، در مرز میان علوم زیستی و فناوریهای نوین فعالیت کرده و رسالت خود را در دسترسپذیر کردن علم برای همگان تعریف کرده است.
بنیان علمی و آکادمیک:
ایشان دارای دکترای تخصصی ژنتیک مولکولی، عضو باشگاه پژوهشگران و نخبگان جوان و دارنده عنوان استعداد درخشان هستند. سوابق تحصیلی و پژوهشی درخشان ایشان با افتخاراتی نظیر کسب عنوان پایاننامه برتر تکمیل میشود که نشاندهنده دقت، عمق و نوآوری در فعالیتهای تحقیقاتی ایشان است.
حوزههای تخصصی و مهارتها:
دکتر نوراللهی یک متخصص بینرشتهای با تسلط بر حوزههای متنوع و استراتژیک است. با بیش از 10 سال تجربه متمرکز در حوزه بیوانفورماتیک، ایشان مهارتهای خود را در زمینههای زیر گسترش دادهاند:
زیستشناسی مولکولی و ژنتیک: درک عمیق از مبانی سلولی و مولکولی حیات. بیوانفورماتیک و زیستمحاسباتی: تحلیل دادههای بیولوژیکی در مقیاس بزرگ (Big Data). هوش مصنوعی و برنامهنویسی: به کارگیری الگوریتمهای AI و Machine Learning برای حل مسائل پیچیده زیستی. طراحی دارو (Drug Design): استفاده از رویکردهای محاسباتی برای کشف و توسعه داروهای نوین. علوم اومیکس (Omics): تسلط بر تحلیل دادههای ژنومیکس، پروتئومیکس و سایر حوزههای اومیکس.
تدریس، آموزش و ترویج علم:
فراتر از فضای آکادمیک، دکتر نوراللهی یک رسالت شخصی برای عمومیسازی علم دارد. ایشان بنیانگذار کانال آموزشی “زیسلند” هستند که با هدف “شکستن دیوارهای مفاهیم پیچیده و ارائه علم به زبانی ساده، تحلیلی و جذاب” ایجاد شده است. ایشان بهعنوان مدرس دورههای پیشرفته و تخصصی در زمینههای هوش مصنوعی، طراحی دارو و بیوانفورماتیک، نقشه راه یادگیری روشنی را برای دانشجویان و علاقهمندان ترسیم میکنند. سابقه تدریس موفق در دانشگاه و برگزاری کارگاههای متعدد، ایشان را به یک مدرس و مربی تأثیرگذار تبدیل کرده است.
دستاوردها و انتشارات:
تعهد ایشان به جامعه علمی در قالب دستاوردهای ملموس نیز متجلی شده است:
سخنرانی برتر در اولین کنگره بینالمللی ژنتیک ایران. ترجمه و چاپ کتاب مرجع “سرطانشناسی در یک نگاه” که نشاندهنده تسلط ایشان بر مفاهیم پیچیده و مهارت بالایشان در ترجمه متون تخصصی است. در حال اتمام ترجمه دو کتاب تخصصی دیگر، که تداوم فعالیت ایشان در این عرصه را نشان میدهد. اجرای موفقیتآمیز پروژههای متعدد پژوهشی و کاربردی.
ویژگیهای حرفهای و شخصیتی:
موفقیتهای دکتر نوراللهی ریشه در ویژگیهای برجسته حرفهای و شخصیتی ایشان دارد:
تعهد و مسئولیتپذیری: تعهد بالا به انجام کارها با نهایت دقت و بالاترین کیفیت. نوآوری و حل مسئله: ذهنی خلاق و خوشفکر با ممارست بالا در یافتن راهحلهای نوآورانه برای چالشهای پیچیده. مهارتهای ارتباطی و رهبری: دارای روحیه کار تیمی قوی، توانایی رهبری، انعطافپذیری و سازگاری بالا. شخصیت الهامبخش: بهعنوان یک مشاور و راهنمای دلسوز، با صبر و حوصله، مسیر رشد را برای دانشجویان و همکاران خود هموار میسازد.
چکیده:
در یک کلام، دکتر حسین نوراللهی ترکیبی از یک پژوهشگر دقیق، یک مدرس الهامبخش، و یک ارتباطگر علمی توانا است که با اشتیاق و تخصص، دانش پیشرفته را از آزمایشگاه و مقالات به کلاس درس و فضای عمومی منتقل میکند و نقشی کلیدی در پرورش نسل آینده دانشمندان و فناوران ایران ایفا مینماید.
اطلاعات بیشتر
