دکتر مسعود نیلی تحصیلات دانشگاهی خود را با ورود به دانشگاه صنعتی شریف در رشته مهندسی سازه آغاز کرد. این اقتصاد دان برجسته در سال 1366 در رشته برنامهریزی سیستمهای اقتصادی از دانشگاه صنعتی اصفهان فوقلیسانس گرفت. چندی بعد برای پیگیری تحصیلات تکمیلیاش راهی انگلستان شد و در سال 1371 دومین فوقلیسانس خود را این بار در رشته اقتصاد از دانشگاه منچستر گرفت. سرانجام در سال 1374 با اخذ مدرک دکتری در رشته اقتصاد از دانشگاه منچستر فارغالتحصیل شد. دکتر نیلی به مدت ۴ سال رئیس دانشکده مدیریت و اقتصاد دانشگاه شریف بوده است. از زمینههای تحقیقاتی مورد علاقه ایشان میتوان به تئوری اقتصاد کلان، اقتصاد کلان بین الملل، اقتصاد سیاسی و اقتصاد ایران اشاره کرد.