آموزش آنالیز RNAseq با سرور Galaxy

در دهه‌های اخیر با توالی‌یابی ژنوم و ترنسکریپتوم موجودات مختلف و تولید حجم عظیم دیتای خام حاصل از آن‌ها، یادگیری روش‌های تجزیه‌وتحلیل این داده‌ها توسط زیست‌شناسان، اهمیت افزونی پیدا کرده به‌طوری‌که در حال حاضر موفقیت‌های ...

4.2 (8 امتیاز)
139 دانشجو
مقدماتی
محتوای دوره
درباره دوره
نظرات کاربران
درباره استاد

آنچه در این دوره می‌آموزید

آشنایی با تکنولوژی RNAseq و تمامی مفاهیم اولیه و کاربردی در این حوزه

انتقال دیتای خام RNAseq از دیتابیس GEO به سرور گلکسی

کنترل کیفیت و حذف خوانش های کم کیفیت

مپینگ خوانش‌ها به ژنوم مرجع

ایجاد فایل Counts

آنالیز افتراقی بیان ژن

محتوای دوره

8 فصل 32 جلسه 4 ساعت ویدیو
مفاهیم کاربردی اولیه
انتقال دیتای خام به سرور Galaxy
کنترل کیفیت
مپینگ
Counting
آنالیز داده های Paired-end
آنالیز افتراقی بیان ژن
Visualization و Functional enrichment analysis

درباره دوره

در دهه‌های اخیر با توالی‌یابی ژنوم و ترنسکریپتوم موجودات مختلف و تولید حجم عظیم دیتای خام حاصل از آن‌ها، یادگیری روش‌های تجزیه‌وتحلیل این داده‌ها توسط زیست‌شناسان، اهمیت افزونی پیدا کرده به‌طوری‌که در حال حاضر موفقیت‌های آکادمیک و تحقیقاتی در حوزهٔ بیولوژی و تقویت رزومه در راستای آن‌ها، علاوه بر تسلط بر تکنیک‌های آزمایشگاهی و درک مفاهیم بنیادین، مستلزم تسلط بر روش‌های بیوانفورماتیکی که از جملهٔ آن‌ها آنالیز داده‌های RNAseq است، می‌باشد.

 کاربردهای RNAseq

 در حال حاضر آنالیز داده‌های RNA sequencing یکی از کارآمدترین و پرکاربردترین روش‌های مطالعهٔ جامع پدیده‌های زیستی است. این آنالیز امکان مقایسهٔ پروفایل بیان ژنی بین سمپل‌های مختلف زیستی را فراهم می‌کند و به این وسیله محققان حوزهٔ زیست‌شناسی را به یافتن الگوهای تغییر بیان ژن‌ها و مسیرهای درون‌سلولی در اثر تغییر شرایط محیطی یا بیماری‌ها و در پی آن به درمان بیماری‌ها قادر می‌سازد. همچنین یافتن بیومارکرهای جدید برای بیماری‌ها از دیگر کاربردهای RNAseq می‌باشد.

 مزیت این دوره بر سایر دوره‌های آنالیز داده‌های RNAseq

 آنالیز داده‌های خام RNAseq نیازمند داشتن دسترسی به سیستم‌های محاسباتی قدرتمند (سرور و یا لپ‌تاپ قدرتمند)، کدنویسی با لینوکس ونرم افزار R یا پایتون می‌باشد. اما استفاده از سرور قدرتمند نیازمند پرداخت هزینه است و دسترسی به آن همیشه مقدور نیست و همچنین زیست‌شناسان معمولاً امکان صرف وقت کمتری برای یادگیری کدنویسی دارند؛ بنابراین در این آموزش ما برای این کار از سرور گلکسی استفاده می‌کنیم که به‌صورت free سیستم محاسباتی باقدرت بالا را در اختیار عموم قرار می‌دهد و توسط رابط کاربری که ایجاد می‌کند امکان آنالیز RNAseq بدون کدنویسی را برای زیست‌شناسان فراهم می‌کند.

 مخاطبین این دوره چه کسانی می‌باشند؟

 یادگیری آنالیز RNAseq دری از مطالعات بیان ژن را به روی محققان تمامی گرایش‌های زیست‌شناسی (سلولی و مولکولی، ژنتیک، میکروبیولوژی، ایمنی‌شناسی، بیوشیمی، علوم جانوری و گیاهی، فیزیولوژی، انگل‌شناسی و...) می‌گشاید و آن‌ها را به نوشتن مقالات علمی در این زمینه و تقویت رزومه ی بین‌المللی قادر می‌سازد

اطلاعات بیشتر

امتیاز و نظرات کاربران

4.2

از مجموع 8 امتیاز

3 نظر

1 ماه پیش

بسیار عالی

دانشجوی دوره

10 ماه پیش

با سلام و وقت بخیر من این دوره رو خریداری کردم بسیار شیوا و روان آموزش داده شده و راضی بودم و پیشنهادمیکنم به دوستان که زبان R یاد ندارن این آموزش خیلی کمک میکنه به فهم مفاهیم کلی RNAseq و انجام آنالیز با سرور گلکسی متشکرم

دانشجوی دوره

1 سال پیش

با سلام بنده این دوره ارزشمند رو خریداری کردم، بسیار ممنون از مدرس که به صورت کاملا جزئی، دقیق، گام به گام و علمی همه نکات لازم رو طی آموزش بیان کردند. امیدوارم به زودی شاهد آموزش های دیگری از این قبیل از مدرس محترم باشیم. خدمت دوستانی که با دیتاهای حجیم و خام NGS کار میکنند مشاهد دوره رو موکدا توصیه میکنم. با تشکر مجدد از مدرس محترم و مکتب خونه 🌹🌹

سعیده صالحی

سعیده صالحی

نظرات بیشتر

دوره‌های پیشنهادی

درباره استاد

مریم السادات مومنی
مریم السادات مومنی
1 دوره
140 دانشجو

مریم السادات مؤمنی فارغ‌التحصیل کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی میکروبی از دانشگاه اصفهان است و ایشان هشت سال سابقهٔ فعالیت تحقیقاتی در زمینه‌ بیوانفورماتیک دارند. وی تجربه کارآموزی‌های بیوانفورماتیک شرکت STEM-Away کالیفرنیا در شاخهٔ آنالیز ترنسکریپتوم و رهبری یک پروژهٔ بیوانفورماتیکی در این شرکت و همکاری در پروژه‌های بیوانفورماتیکی مراکز تحقیقاتی دانشگاه علوم پزشکی اصفهان را دارد.

اطلاعات بیشتر

سوالات پرتکرار

پس از سپری شدن زمان دوره، به محتوای دوره دسترسی خواهم داشت؟

بله؛ پس از سپری شدن مدت زمان دوره شما به محتوای دوره دسترسی خواهید داشت و می توانید از ویدئوها، تمارین، پروژه و دیگر محتوای دوره در صورت وجود استفاده کنید ولی امکان تصحیح تمارین توسط پشتیبان و دریافت گواهی نامه برای شما وجود نخواهد داشت.

دانلود اپلیکیشن مکتب‌خونه

مکتب خونه، آکادمی آنلاین تخصص‌ها

مکتب خونه بزرگ‌ترین پلتفرم آموزش مجازی در ایران محسوب می‌شود که بیش از یک دهه است در زمینه آموزش مجازی فعالیت می‌کند. از اهداف مهم مکتب خونه در دسترس قرار دادن آموزش‌ها برای تمام مردم در گروه‌های سنی مختلف می‌توان نام برد. این مکتبِ مجازی، بر این باور است که هیچکس نباید به خاطر شرایط مالی و یا موقعیت مکانی از بهره‌گیری آموزش‌ها باز بماند و باور دارد که می‌تواند این هدف را به سرانجام برساند.

مکتب خونه در چه زمینه‌ای خدمات ارائه می‌دهد؟

مکتب خونه یک آکادمی آنلاین تخصص‌ها است که دروس مختلفی را در زمینه‌های متنوع ارائه می‌دهد. شما می‌توانید در مکتب‌خونه دوره‌های رایگان و پلاس را در حوزه‌های مختلف ببینید.

برنامه‌نویسی

دوره‌های آموزش برنامه نویسی به شما کمک می‌کنند تا به یکی از پردرآمدترین و جذاب‌ترین مهارت‌های دنیای امروز مسلط شوید. آموزش یادگیری ماشین و آموزش پردازش تصویر تا آموزش طراحی سایت، همه چیز برای ورود به دنیای تکنولوژی فراهم است. این دوره‌ها مناسب هر سطحی از مبتدی تا حرفه‌ای هستند.

آی‌تی و نرم‌افزار

در دنیای امروزی، یادگیری مهارت‌های آی‌تی و نرم‌افزار امری ضروری است. دوره‌های مکتب‌خونه در این زمینه مانند دوره‌های آموزش شبکه، آموزش CCNA ، آموزش بلاک چین و غیره، به شما کمک می‌کنند تا مهارت‌هایی چون مدیریت شبکه و استفاده از نرم‌افزارهای مختلف را به راحتی و از صفر تا صد بیاموزید. بدون نیاز به پیش‌زمینه تخصصی، این دوره‌ها شما را برای ورود به بازار کار آماده می‌کنند.

زبان‌های خارجی

اگر به دنبال یادگیری زبان جدید هستید یا می‌خواهید مهارت‌های زبانی خود را تقویت کنید، مکتب‌خونه با دوره‌های متنوع آموزش زبان انگلیسی، آموزش زبان فرانسوی، آموزش زبان آلمانی و بسیاری دیگر، بهترین گزینه برای شما است. شما می‌توانید با تمرین و آموزش‌های ساختارمند به سرعت در زبان‌های مختلف پیشرفت کنید و دنیایی از فرصت‌های جدید را پیش‌روی خود ببینید.

مدیریت و کسب‌وکار

آموزش‌های مدیریت و کسب‌وکار مکتب‌خونه برای کسانی است که می‌خواهند موفقیت در دنیای تجارت را تجربه کنند. با دوره‌هایی از آموزش مدیریت، دوره منابع انسانی ، آموزش هوش تجاری و تحلیل داده‌ها تا کارآفرینی و آموزش فروش، می‌توانید مهارت‌های لازم برای راه‌اندازی و مدیریت یک کسب‌وکار موفق را کسب کرده و ایده‌های خود را به واقعیت تبدیل کنید.

مالی و سرمایه‌گذاری

در دنیای پیچیده امروزی، داشتن دانش مالی و سرمایه‌گذاری کلید موفقیت است. مکتب‌خونه با دوره‌های مالی و سرمایه‌گذاری در دسته‌بندی‌های مختلف مانند آموزش پرایس اکشن، آموزش تحلیل تکنیکال و غیره، شما را به مهارت‌هایی مجهز می‌کند که بتوانید بهترین تصمیمات مالی را بگیرید و سرمایه‌گذاری‌های خود را هوشمندانه مدیریت کنید.

دانشگاهی: فنی و مهندسی

دوره‌های فنی و مهندسی مکتب‌خونه برای دانشجویان و علاقه‌مندان به این حوزه فرصتی عالی است تا مفاهیم کلیدی و تخصصی در آموزش مهندسی کامپیوتر، آموزش مهندسی مکانیک، عمران و سایر رشته‌های فنی را با اساتید برتر کشور یاد بگیرند. این دوره‌ها از بهترین اساتید و دانشگاه‌های کشور مانند دانشگاه صنعتی شریف و دانشگاه تهران به شما کمک می‌کنند تا دروس دانشگاهی را به‌خوبی درک کنید و مهارت‌های عملی خود را ارتقا دهید.

مهارت‌های زندگی

مهارت‌های زندگی نقش مهمی در موفقیت و رضایت شخصی دارند. مکتب‌خونه با ارائه دوره‌های متنوع در زمینه‌های مانند آموزش مدیریت تعارض، مهاجرت کاری، مهارت‌های ارتباطی و غیره، به شما کمک می‌کند تا زندگی متعادل‌تر و موفق‌تری داشته باشید. این دوره‌ها به شما ابزاری برای بهتر زندگی کردن و برخورد با چالش‌های روزمره می‌دهد.

دانشگاهی: علوم‌پایه، انسانی، پزشکی

مکتب‌خونه برای دانشجویان و علاقه‌مندان به علوم پایه، علوم انسانی و پزشکی، دوره‌هایی کاربردی و مفید را فراهم کرده است. با این دوره‌ها می‌توانید از یادگیری دروس پیچیده‌ای مثل فیزیک، شیمی، روانشناسی، اقتصاد و حتی دروس پزشکی بهره‌مند شوید و پایه‌های علمی خود را تقویت کنید.

هنر

اگر به دنبال پرورش استعدادهای هنری خود هستید، مکتب‌خونه با دوره‌های هنری در زمینه‌هایی مانند آموزش گرافیک ، آموزش عکاسی، آموزش نستعلیق، طراحی مد و معماری، بهترین انتخاب است. این دوره‌ها به شما کمک می‌کنند تا خلاقیت خود را به شکلی حرفه‌ای و قابل اجرا به کار بگیرید و در مسیر هنری خود پیشرفت کنید.

دوره های رایگان مکتب خونه

مکتب خونه علاوه بر ارائه دادن دوره‌های پلاس، مجموعه‌ای شامل ۱۵۰۰۰ ساعت ویدئوی آموزشی رایگان ارائه داده است. این ویدئو‌های رایگان در زمینه آی تی، برنامه‌نویسی، مدیریت و کارآفرینی، مالی و سرمایه‌گذاری، علوم انسانی وغیره هستند. رایگان بودن این دوره‌ها از کیفیت این دوره‌ها کم نمی‌کند؛ بلکه آموزش و تهیه این ویدئو‌ها توسط اساتید خبره ایران تدارک دیده شده است. اکثر این استادان برجسته از دانشگاه برتر شهید بهشتی، ‌امیر کبیر، صنعتی شریف و غیره هستند. آکادمی مکتب خونه سعی دارد با انجام پروژه‌های رایگان در راستای تحقق اهداف خود قدمی بردارد.

مشاهده بیشتر
enamad
logo-samandehi
تمام حقوق این وب‌سایت برای شرکت ندای دانش همراه ایرانیان (مکتب‌خونه‌‌‌‌) است.