بیوانفورماتیک پیشرفته

دوره‌های دانشگاهی
31 جلسه

سرفصل‌ها

درباره شرح دوره ویدئوی معرفی درس را مشاهده نمایید.

اسلایدهای این درس را از اینجا دانلود کنید.

مدرس دوره
علی شریفی زارچی

علی شریفی زارچی دانش آموخته کارشناسی و کارشناسی ارشد مهندسی کامپیوتر از دانشگاه صنعتی شریف و دکتری بیوانفورماتیک از دانشگاه تهران است.

وی دوره‌های پژوهشی و پسادکتری را در Max Planck Institute آلمان و Colorado State University آمریکا پشت سر گذاشته‌است.

او از سال ۱۳۹۰ تاکنون به عنوان پژوهشگر بیوانفورماتیک در پژوهشگاه رویان‌ و هم‌چنین از سال ۱۳۹۵ به عنوان عضو هیات علمی دانشکده‌ی مهندسی کامپیوتر دانشگاه صنعتی شریف مشغول به کار است.

زمینه های تحقیقاتی مورد علاقه ایشان به کارگیری الگوریتم و هوش مصنوعی در بیوانفورماتیک و تحلیل داده‌های زیست‌پزشکی است.

فیلم های آموزشی
ساعت
44:59 ساعت
Combined Shape Created with Sketch. 31 جلسه
جلسه 1 | سلول | Cells
"82:31
جلسه 2 | پروتئین | Protein
"80:16
جلسه 3 | دنا | DNA
"82:43
جلسه 4 | رونویسی | Transcription
"86:29
جلسه 5 | ترجمه | Translation
"64:47
جلسه 6 | تمایز سلولی | Cell Differentiation
"67:36
جلسه 7 | فناوری‌های توالی‌یابی | بخش اول | Sequencing Technologies I
"85:06
جلسه 8 | فناوری‌های توالی‌یابی | بخش دوم | Sequencing Technologies II
"80:34
جلسه 9 | تحلیل داده‌های ریزآرایه | بخش اول | Microarray Data Analysis I
"85:30
جلسه 10 | تحلیل داده‌های ریزآرایه | بخش دوم | Microarray Data Analysis II
"96:24
جلسه 11 | تحلیل داده‌های ریزآرایه | بخش سوم | Microarray Data Analysis III
"112:50
جلسه 12 | تحلیل داده‌های ریزآرایه | بخش چهارم | Microarray Data Analysis IV
"56:18
جلسه 13 | تحلیل داده‌های توالی‌یابی رنا | بخش اول | RNA-Seq Data Analysis I
"114:22
جلسه 14 | تحلیل داده‌های توالی‌یابی رنا | بخش دوم | RNA-Seq Data Analysis II
"106:29
جلسه 15 | تحلیل داده‌های توالی‌یابی رنا | بخش سوم | RNA-Seq Data Analysis III
"138:29
جلسه 16 | تحلیل داده‌های توالی‌یابی رنا | بخش چهارم | RNA-Seq Data Analysis IV
"72:07
جلسه 17 | پایگاه داده‌های مفید | Useful Online Databases
"85:45
جلسه 18 | هم‌ردیفی | بخش اول | Alignment I
"84:10
جلسه 19 | هم‌ردیفی | بخش دوم | Alignment II
"77:29
جلسه 20 | هم‌ردیفی | بخش سوم )+ متیل‌دارشدن دنا( | Alignment III (+ DNA Methylation)
"86:43
جلسه 21 | بازسازی | بخش اول | Assembly I
"77:36
جلسه 22 | بازسازی | بخش دوم | Assembly II
"90:32
جلسه 23 | بازسازی | بخش سوم | Assembly III
"80:11
جلسه 24 | تأثیر ترکیب داده‌ها | بخش اول | Batch Effect I
"74:55
جلسه 25 | تأثیر ترکیب داده‌ها | بخش دوم | Batch Effect II
"91:50
جلسه 26 | تحلیل مجموعه ژن‌ها | Gene Set Enrichment Analysis
"83:57
جلسه 27 | خوشه‌بندی | Clustering
"96:51
جلسه 28 | دسته‌بندی | بخش اول )+ تحلیل گراف، سل‌نت) | Classification I (+ Graph Analysis, CellNet)
"80:56
جلسه 29 | دسته‌بندی | بخش دوم | Classification II
"79:55
جلسه 30 | مطالعه موردی | ایسکمی قلب | Case Study | Heart Ischemia
"95:34
جلسه 31 | شبکه‌های عصبی ژرف | Deep Neural Networks
"100:02