بیوانفورماتیک پیشرفته

درباره شرح دوره ویدئوی معرفی درس را مشاهده نمایید. برای دانلود Ubuntu Image در VirtualBox می‌توانید از لینک زیر استفاده کنید:https://www.osboxes.org/ubuntu همچنین اسلایدهای این درس را از اینجا دانلود کنید. ... ادامه

مدرس دوره:
5 (28 رای)
 رایگان
  
زمان مورد نیاز برای گذارندن دوره:  31 جلسه
مجموع محتوای آموزشی:  45 ساعت ویدئو
 (قابل دانلود می‌باشد)

سرفصل‌های دوره بیوانفورماتیک پیشرفته

فیلم های آموزشی
  جلسه 1 | سلول | Cells
"82:31  
  جلسه 2 | پروتئین | Protein
"80:16  
  جلسه 3 | دنا | DNA
"82:43  
  جلسه 4 | رونویسی | Transcription
"86:29  
  جلسه 5 | ترجمه | Translation
"64:47  
  جلسه 6 | تمایز سلولی | Cell Differentiation
"67:36  
  جلسه 7 | فناوری‌های توالی‌یابی | بخش اول | Sequencing Technologies I
"85:06  
  جلسه 8 | فناوری‌های توالی‌یابی | بخش دوم | Sequencing Technologies II
"80:34  
  جلسه 9 | تحلیل داده‌های ریزآرایه | بخش اول | Microarray Data Analysis I
"85:30  
  جلسه 10 | تحلیل داده‌های ریزآرایه | بخش دوم | Microarray Data Analysis II
"96:24  
  جلسه 11 | تحلیل داده‌های ریزآرایه | بخش سوم | Microarray Data Analysis III
"112:50  
  جلسه 12 | تحلیل داده‌های ریزآرایه | بخش چهارم | Microarray Data Analysis IV
"56:18  
  جلسه 13 | تحلیل داده‌های توالی‌یابی رنا | بخش اول | RNA-Seq Data Analysis I
"114:22  
  جلسه 14 | تحلیل داده‌های توالی‌یابی رنا | بخش دوم | RNA-Seq Data Analysis II
"106:29  
  جلسه 15 | تحلیل داده‌های توالی‌یابی رنا | بخش سوم | RNA-Seq Data Analysis III
"138:29  
  جلسه 16 | تحلیل داده‌های توالی‌یابی رنا | بخش چهارم | RNA-Seq Data Analysis IV
"72:07  
  جلسه 17 | پایگاه داده‌های مفید | Useful Online Databases
"85:45  
  جلسه 18 | هم‌ردیفی | بخش اول | Alignment I
"84:10  
  جلسه 19 | هم‌ردیفی | بخش دوم | Alignment II
"77:29  
  جلسه 20 | هم‌ردیفی | بخش سوم )+ متیل‌دارشدن دنا( | Alignment III (+ DNA Methylation)
"86:43  
  جلسه 21 | بازسازی | بخش اول | Assembly I
"77:36  
  جلسه 22 | بازسازی | بخش دوم | Assembly II
"90:32  
  جلسه 23 | بازسازی | بخش سوم | Assembly III
"80:11  
  جلسه 24 | تأثیر ترکیب داده‌ها | بخش اول | Batch Effect I
"74:55  
  جلسه 25 | تأثیر ترکیب داده‌ها | بخش دوم | Batch Effect II
"91:50  
  جلسه 26 | تحلیل مجموعه ژن‌ها | Gene Set Enrichment Analysis
"83:57  
  جلسه 27 | خوشه‌بندی | Clustering
"96:51  
  جلسه 28 | دسته‌بندی | بخش اول )+ تحلیل گراف، سل‌نت) | Classification I (+ Graph Analysis, CellNet)
"80:56  
  جلسه 29 | دسته‌بندی | بخش دوم | Classification II
"79:55  
  جلسه 30 | مطالعه موردی | ایسکمی قلب | Case Study | Heart Ischemia
"95:34  
  جلسه 31 | شبکه‌های عصبی ژرف | Deep Neural Networks
"100:02  

درباره دوره

درباره شرح دوره ویدئوی معرفی درس را مشاهده نمایید.

برای دانلود Ubuntu Image در VirtualBox می‌توانید از لینک زیر استفاده کنید:
https://www.osboxes.org/ubuntu

همچنین اسلایدهای این درس را از اینجا دانلود کنید.

درباره استاد

maktabkhooneh-teacher علی شریفی زارچی

علی شریفی زارچی دانش‌آموخته کارشناسی و کارشناسی ارشد مهندسی کامپیوتر از دانشگاه صنعتی شریف و دکتری بیوانفورماتیک از دانشگاه تهران است.

وی دوره‌های پژوهشی و پسادکتری را در Max Planck Institute آلمان و Colorado State University آمریکا پشت سر گذاشته‌است.

او از سال ۱۳۹۰ تاکنون به عنوان پژوهشگر بیوانفورماتیک در پژوهشگاه رویان‌ و هم‌چنین از سال ۱۳۹۵ به عنوان عضو هیأت علمی دانشکده‌ی مهندسی کامپیوتر دانشگاه صنعتی شریف مشغول به کار است.

زمینه‌های تحقیقاتی مورد علاقه ایشان به کارگیری الگوریتم و هوش مصنوعی در بیوانفورماتیک و تحلیل داده‌های زیست‌پزشکی است.

مشاهده پروفایل و دوره‌‌های استاد

نظرات کاربران

تا کنون نظری برای این دوره ثبت نشده است. برای ثبت نظر باید ابتدا در دوره ثبت نام کرده و دانشجوی دوره باشید.
صدرا حکیم 1402-08-19
واقعا یکی از قشنگ‌ترین دوره‌هایی هست که تا حالا گذرانده‌ام. بسیار بسیار مباحث شیرین و قشنگ هستند و با فن‌بیان آقای دکتر شریفی، بی‌نهایت مطالب قشنگ‌تر می‌شوند. این دوره را شدیدا پیشنهاد می‌کنم. ای کاش مکتب‌خونه کیفیت ویدیوها را بهتر می‌کرد. در بعضی از جاهای فیلم‌ها هست که اصلا دوربین سمت دیگه‌اس و حواس فیلم‌بردار نیست... . امیدوارم دقت بیشتری روی این موضوع صورت بگیره.
1402-08-07
وقعا عالیه آموزش ایشون و از ایشون خیلی ممنونم که همچین آموزشی رو رایگان در خدمت همه گذاشتن . فقط قسمت code های R رو از کجا دسترسی داریم . من بعضی از جا ها رو تیکه تیکه stop کردم که تونستم با کلی اشتباه و سعی و خطا کد ها رو بنویسم که خوش باعث شد یکم R یاد بگیرم با این که python کار هستم
1402-07-16
خدا قوت بر همه دست اندر کاران از جمله مدرس(استاد شریف زارچی) البته رشته بنده چون زیر مجموعه پزشکی است و پیش درسها را نداشته ام همانند دانشجویان مربوطه مسلط نیستم اما برایم ارتباط بیولوژی آن بسیار مفید است
1401-10-03
با سلام بسیار مطالب مفیدی در سایت هست ولی در مورد چگونگی کار با دیتا بیس TCGA هیچ مطلبی نیست لطفا در صورت امکان از این دیتا بیس هم مطالبی اضافه کنید. با تشکر
1401-05-17
واقعا عالی . خیلی چیزی یاد گرفتم. حیف درس شماره 7، تصویر دکتر و نوشته های ایشون رو نداره. و نتونستم کامل بهره ببرم.
محمدامین سلطانیان 1401-04-26
واقعا دیگه جایی برای نظر دادن نیست همه چیز عالیه فقط میتونم هزاران بار ازتون تشکر کنم ممنونم عالی عالی عالی
1400-07-02
ممنون
ناهید کائیدی مرزیجرانی 1400-06-27
عالی و بی نظیرید پاینده و باشید و پایدار ممنون از سایت مکتب خونه و آقای دکتر که نمیشه لطفشون را در اختیار گذاشتن کلاس هاشون جبران کرد. به حق قرانی که همیشه می خونید خداوند نگهدارتون باشه
آرش 1400-06-10
کسی هستم که کمتر جایی کامنت میزارم اما درمورد جناب دکتر بزرگوار و همچنین سایت مکتب خونه، بر خودم لازم میدونم که از صمیم قلب ازتون تشکر کنم. واقعا درازای کار خیر شما و جناب دکتر که این دوره فوق العاده (و سایر دوره های مرتبط رو) به رایگان و با این کفیت ارائه دادید، چطوری تشکر کردن هم سخته. امیدوارم همیشه پاینده، سرزنده و سلامت باشید
1399-12-06
برای شروع یادگیری خیلی خوب هستند. البته با توجه به ذات رشته بیوانفورماتیک، بسیاری از این آموزشها نیاز به روزآمد شدن، دارند.
1399-11-25
این آموزش ها فوق العاده هستن. حتما جناب اقای دکتر شریفی قلبی از طلا و به وسعت دریا دارن چون کسانی رو میشناسم که چیزکی از این مطالب میدونن و اون اندک دانسته رو یا از دیگران دریغ می کنن و یا پول حسابی ازت میگیرن. بهترین ها رو از خدا می خوام برای همه کسانی که در ایجاد این مطالب اموزشی مشارکت داشتن.
سارا علیدادیانی 1399-11-21
دوره های اقای دکتر شریفی زارچی فوق العاده هستند ممنون از ایشون و تیم خوب مکتب خونه. امکانش هست دیتاهای جلسه 27 (clustering) و 30 رو قرار بدید یا لینکی که بهش بشه دسترسی داشت؟ با سپاس فراوان
مکتب‌خونه
سارا عزیز؛ از اینکه نظر خود را با ما در میان گذاشتید صمیمانه سپاسگزاریم. تمامی فایل ها و ویدئوهایی که در اختیار مکتب خونه قرار گرفته روی سایت آپلود شده است. با استاد مکاتبه خواهیم کرد. در صورتی که فایل ها را در اختیار ما قرار دهند روی سایت قرار خواهیم داد.
محمد امین الماسیه 1399-07-29
سپاس گذارم، واقعا آموزش ها بی نظیره، خدا حفظت کنه استاد شریفی
نساء کاظمی فرد 1399-07-08
خیلی این دوره کاربردی و عالیه
1399-07-03
عالیه این کورس فقط استاد خیلی کند صحبت میکنه:)
1
2

دوره‌های پیشنهادی

سوالات پرتکرار

آیا ممکن است که درسی ناقص ضبط شده باشد؟
ما همواره تلاش کرده­‌ایم که دروس را به طور کامل ضبط نماییم و در اختیار شما دوستان قرار دهیم. اما گاهی برخی ناهماهنگی ها سبب می شود که یک یا تعدادی از جلسات یک درس ضبط نشود. توضیح این گونه نواقص در توضیح درس­ ها آمده است.

سوالات پرتکرار

اگر لینک دانلود یا پخش ویدئو مشکل داشت چه باید کرد؟
در صورتی که با هر گونه مشکلی رو به رو شدید می توانید از طریق صفحه ارتباط با ما به ما اطلاع دهید تا ما سریعا مشکل را پیگیری و برطرف نماییم.

سوالات پرتکرار

آیا امکان دریافت فیلم های یک درس به صورت سی دی یا دی وی دی وجود دارد؟
در حال حاضر امکان ارسال دروس به صورت سی دی یا دی وی دی وجود ندارد.
poster
  
برگزار کننده:  دانشگاه صنعتی شریف
  
زمان مورد نیاز برای گذارندن دوره:  31 جلسه
مجموع محتوای آموزشی:  45 ساعت ویدئو
 (قابل دانلود می‌باشد)